Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab11fip1Q9D620 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip1Q9D620 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip1Q9D620 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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