Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc39Q9D5Y1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc39Q9D5Y1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms