Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930449I24RikQ9D5E3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
4930449I24RikQ9D5E3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930449I24RikQ9D5E3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms