Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3a3Q9D554 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3a3Q9D554 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms