Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam227bQ9D518 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam227bQ9D518 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam227bQ9D518 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms