Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cul2Q9D4H8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul2Q9D4H8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul2Q9D4H8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms