Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snrnp35Q9D384 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp35Q9D384 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms