Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms