Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms