Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TbcbQ9D1E6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TbcbQ9D1E6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TbcbQ9D1E6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms