Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbr1lQ9D1E5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbr1lQ9D1E5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms