Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc167Q9D162 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms