Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem53Q9D0Z3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem53Q9D0Z3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem53Q9D0Z3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem53Q9D0Z3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem53Q9D0Z3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem53Q9D0Z3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem53Q9D0Z3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem53Q9D0Z3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms