Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mms19Q9D071 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mms19Q9D071 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms