Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl35Q9CZ49 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl35Q9CZ49 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl35Q9CZ49 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms