Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snf8Q9CZ28 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Snf8Q9CZ28 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms