Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp2Q9CYZ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms