Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdhd3Q9CYW4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdhd3Q9CYW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.9 ms