Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChtopQ9CY57 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChtopQ9CY57 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms