Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2fQ9CY34 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2fQ9CY34 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms