Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl11Q9CXW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl11Q9CXW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms