Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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Sgo1Q9CXH7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Sgo1Q9CXH7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Sgo1Q9CXH7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Sgo1Q9CXH7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Sgo1Q9CXH7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sgo1Q9CXH7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sgo1Q9CXH7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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