Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXG9

Phf19, PHD finger protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf19Q9CXG9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf19Q9CXG9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf19Q9CXG9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms