Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd4Q9CWX4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpusd4Q9CWX4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms