Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufaf1Q9CWX2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms