Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxxc1Q9CWW7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cxxc1Q9CWW7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cxxc1Q9CWW7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms