Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CWU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CWU4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CWU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CWU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms