Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc1aQ9CU62 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smc1aQ9CU62 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smc1aQ9CU62 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms