Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CRC3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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