Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Exosc5Q9CRA8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exosc5Q9CRA8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms