Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox16Q9CR63 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox16Q9CR63 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox16Q9CR63 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox16Q9CR63 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox16Q9CR63 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox16Q9CR63 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox16Q9CR63 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox16Q9CR63 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cox16Q9CR63 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox16Q9CR63 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms