Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931417E11RikQ9CR05 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931417E11RikQ9CR05 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms