Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mri1Q9CQT1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mri1Q9CQT1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mri1Q9CQT1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mri1Q9CQT1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mri1Q9CQT1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mri1Q9CQT1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mri1Q9CQT1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mri1Q9CQT1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mri1Q9CQT1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms