Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp5f1Q9CQQ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp5f1Q9CQQ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp5f1Q9CQQ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.1 ms