Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd5Q9CQP3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chchd5Q9CQP3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd5Q9CQP3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd5Q9CQP3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd5Q9CQP3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd5Q9CQP3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chchd5Q9CQP3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chchd5Q9CQP3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chchd5Q9CQP3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chchd5Q9CQP3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chchd5Q9CQP3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chchd5Q9CQP3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chchd5Q9CQP3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chchd5Q9CQP3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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