Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9CQF4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQF4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms