Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q9CQ90 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQ90 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms