Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpa3Q9CQ71 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpa3Q9CQ71 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpa3Q9CQ71 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms