Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
StambpQ9CQ26 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
StambpQ9CQ26 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms