Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atg3Q9CPX6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg3Q9CPX6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms