Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80bQ99PT3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80bQ99PT3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80bQ99PT3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80bQ99PT3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms