Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt23Q99PS0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt23Q99PS0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms