Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep41Q99NF3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep41Q99NF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms