Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bco2Q99NF1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bco2Q99NF1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Bco2Q99NF1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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