Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rims1Q99NE5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rims1Q99NE5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms