Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkd1Q99MH6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nkd1Q99MH6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms