Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b4Q99ME6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b4Q99ME6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Atp1b4Q99ME6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms