Protein–RNA interactions for Protein: Q99LQ4

Svbp, Small vasohibin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvbpQ99LQ4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SvbpQ99LQ4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvbpQ99LQ4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms