Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cstf3Q99LI7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cstf3Q99LI7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cstf3Q99LI7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cstf3Q99LI7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cstf3Q99LI7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cstf3Q99LI7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms