Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nmd3Q99L48 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nmd3Q99L48 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms